Section author: Vedran Miletić

Baza struktura proteina RCSB PDB

RCSB PDB je najpoznatija baza struktura proteina. Strukture proteina dobivene su različitim eksperimentalnim metodama.

Svaki protein u bazi ima jedinstven kod koji se sastoji od 4 slova ili brojke.

Pretraživanjem dobivamo rezultate koje možemo preuzimati jedan po jedan ili odjednom odabirom mogućnosti Download Selected Files.

Odabirom jednog proteina iz rezultata i otvaranjem njegove stranice dobivamo brojne podatke strukturi (eksperimentalna metoda kojom je dobivena, ligandi koji su vezani na protein, sekvence, radovi i drugo). Postoji mogućnost pregledavanja prikaza različitih struktura ako ih je više te mogućnost pregledavanja 3D prikaza proteina već u samom web pregledniku.

Osim toga, imamo mogućnost preuzimanja sekvence proteina u formatu FASTA i strukture proteina u formatu PDB i brojnim drugima.

Ostale baze proteina

  • UniProt je baza sekvenci proteina i pripadnih funkcionalnih informacija.

  • GPCRdb je baza fokusirana na receptore spregnuti s G-proteinom.